Il Ministero dei trasporti era il dicastero del governo Italiano preposto ai trasporti sulle reti stradali, autostradali, ferroviarie, aeroportuali. Il Ministero dei trasporti proponeva, di concerto con il Ministero delle infrastrutture, il piano generale dei trasporti e della logistica e i piani di settore per i trasporti, compresi i piani urbani di mobilità, ed esprimeva, per quanto di competenza, il concerto sugli atti di programmazione degli interventi di competenza del Ministero delle Infrastrutture. Il Ministero venne soppresso con la riforma Bassanini ex d.lgs. 30 luglio 1999, n. 300, entrata in vigore nel 2001.
Attualmente le sue funzioni sono svolte dal Ministero delle infrastrutture e dei trasporti.
Già presente nel governo Boselli, il dicastero venne istituito il 22 giugno 1916 con la denominazione di Ministero dei trasporti marittimi e ferroviari. Col governo Nitti II, dal 21 maggio 1920 il dicastero viene soppresso ed accorpato col Ministero dei lavori pubblici. Con decreto luogotenenziale del 12 dicembre 1944, n. 413, il Ministero dei trasporti viene scorporato dal Ministero delle comunicazioni, ove già da tempo un sottosegretario si occupava di trasporti, ferrovie e strade. La parte restante relativa a telefoni, telegrafi e simili venne eretta in Ministero delle Poste e delle Telecomunicazioni. Col governo Leone I, nel 1963 viene aggiunta la componente sull'aviazione civile, con conseguente cambiamento di denominazione in Ministero dei trasporti e dell'aviazione civile. Con governo Moro IV, nel 1974 perde la competenza sull'aviazione civile, e ritorna Ministero dei trasporti. Nel 1993-1994, nell'ambito della prima razionalizzazione dell'organizzazione ministeriale viene accorpato con il Ministero della marina mercantile, e col governo Berlusconi I, nel 1994 viene denominato Ministero dei trasporti e della navigazione. Con la riforma Bassanini, del D. Lgs. n. 300/1999, attuata dal Governo Berlusconi II nel 2001 e sino al 2006, questo fu accorpato insieme a parte del Ministero dei Lavori Pubblici nel nuovo Ministero delle infrastrutture e dei trasporti. Col Governo Prodi II, nel 2006 fu nuovamente istituito, per essere poi riaccorpato nel Ministero delle infrastrutture e dei trasporti dal governo Berlusconi IV.