Il Ministero dell'Italia occupata fu istituito dal Governo Bonomi III con decreto n. 395 del 12 dicembre 1944 per coordinare i rapporti con il CLNAI e il CVL, oltre che per fornire assistenza alla popolazione del Nord Italia.
Nel 1945, presso il Sottosegretariato del Ministero dell'Italia Occupata, fu insediata la Commissione Centrale per i crimini di guerra, al fine di accertare i delitti compiuti dai tedeschi e dai fascisti in danno della popolazione civile italiana dopo il 25 luglio 1943.
Fu soppresso con Decreto Luogotenenziale n. 391 del 5 luglio 1945, le attribuzioni concernenti l'assistenza ai patrioti furono trasferite al Ministero dell'assistenza postbellica, a sua volta soppresso con Decreto Legislativo del Capo provvisorio dello Stato, n. 27 del 14 febbraio 1947.
Struttura amministrativa
Struttura amministrativaMinistro Mauro Scoccimarro,
Sottosegretario Aldobrando Medici Tornaquinci