Discende dal 7° Grande Comando Militare costituito nel settembre 1862 e soppresso il 1 marzo 1867. Ricostituito il 30 settembre 1873 quale 7° Comando Generale, a datare dal 22 marzo 1877 diviene VII Corpo d'Armata e tale rimane sino al 20 settembre 1944. Assolve compiti territoriali ad esclusione dei periodi di mobilitazione relativi alle campagne di guerra.
Il 10 aprile 1945 si forma il VII Comando Militare Territoriale che dal 10 luglio 1957 cambia denominazione in Comando Regione Militare Tosco Emiliana-VIJ CMT con giurisdizione su Toscana, Emilia-Romagna e province di La Spezia, Ancona e Pesaro. Con il riassetto ordinativo dell'organizzazione territoriale, il 1 aprile 1983 diviene Comando Regione Militare Tosco-Emiliana e cede la giurisdizione della provincia di La Spezia alla RMNO e delle province di Ancona e Pesaro alla RM Centrale. Ha sede a Firenze.
Nell'ambito del progetto di riordinamento della Forza Armata, che prevede la riduzione delle Regioni Militari da sette a tre, viene riconfigurato in data 1 luglio 1998 in Comando Regione Militare Centro ed estende la propria giurisdizione alle regioni amministrative Marche, Umbria, Abruzzo, Lazio e Sardegna. Nella circostanza assume alle dipendenze gli organi territoriali che rimangono in vita della soppressa Regione Militare Centrale, il Comando della Capitale ed il Comando Militare Autonomo della Sardegna.